जीएसएलवी एमके-III वाहन का ऊपरी चरण क्रायोजेनिक इंजन (सीई) -20 द्वारा संचालित होता है जो निर्वात में 442 सेकंड के विशिष्ट आवेग के साथ 186.36 केएन का नाममात्र जोर विकसित करता है। इंजन LOX / LH2 प्रणोदक संयोजन का उपयोग करके गैस जनरेटर चक्र पर संचालित होता है। इंजन के प्रमुख सबसिस्टम थ्रस्ट चेंबर, गैस जनरेटर, LOX और LH2 टर्बो पंप, इग्नाइटर, थ्रस्ट एंड मिक्सचर रेश्यो कंट्रोल सिस्टम, स्टार्ट-अप सिस्टम, कंट्रोल कंपोनेंट्स और पायरो वॉल्व हैं। CE-20 एकीकृत इंजन का पांचवां हार्डवेयर जिसे E6 के रूप में नामित किया गया है, GSLV Mk-III M1-चंद्रयान 2 मिशन के लिए निर्धारित किया गया है।
11 अक्टूबर, 2018 को हाई एल्टीट्यूड टेस्ट सुविधा, इसरो प्रोपल्शन कॉम्प्लेक्स (आईपीआरसी), महेंद्रगिरि में ई6 इंजन की उड़ान स्वीकृति हॉट टेस्ट का 25 सेकंड के लिए सफलतापूर्वक परीक्षण किया गया। परीक्षण ने इंजन के स्थिर स्थिति संचालन का प्रदर्शन किया। हॉट टेस्ट के दौरान सभी इंजन सबसिस्टम का प्रदर्शन सामान्य पाया गया।